Klone kannst du problemlos weiter zur Zucht verwenden da wird nichts reset würde ich aber nur am Anfang machen da es keinen Sinn macht eine Mutation zu klonen oder meinst du das Mutagen von Gen2 das wird übernommen.

Was Kastration angeht weiß ich nicht glaube aber nicht.

EDIT:// habe gerade noch einmal das Ark Wiki herangezogen und dort steht

"If the original creature was spayed/neutered, so will the clone."

knapp übersetzt: " wenn der Klon kastraiert/sterilisiert ist, dann ist es der Klon auch."

weiteres findest du hier: Cloning Chamber