Jedes physische Objekt besitzt, wenn man es angibt, einen "Kollisionsradius" der Vom Entwickler festgelegt wird.
Diesen kannst du dir so vorstellen, wie ein unsichtbares Netz, das sich über das Objekt legt. Nun gibt es aber unebenheiten in Foundations und auch im Boden. Der Dino besitzt den Kollisionsradius und auch der Boden hat einen. Nun wird in der Entwicklung festgelegt, in welcher höhe sich der Dino auf dem Boden bewegen und stehen soll. Da der Boden aber uneben und nicht immer 100% gerade ist, kann es sein, dass die Beine des Dinos (auch durch ihre Bewegung, wenn sie nur rumstehen und nicht verwendet werden) unter dieses "Raster" sinken und sich somit visuell unter dem Boden befinden. Wenn du den Dino bewegst, wird das neu berechnet und er ist wieder an der "Oberfläche".
Das kann man leider nicht ändern, da es noch keine wirklcihe "dynamische" Berechnung von Kollisionsrastern gibt, weil das vielzuviel Rechenleistung brauchen würde.