hast du mal versucht es direkt über die ini einzustelln?
solltest du die steam version spielen findest du die inis unter folgendem pfad:
C:\Program Files (x86)\Steam\steamapps\common\ARK\ShooterGame\Saved\Config\WindowsNoEditor
dort gehst du in die gameusersettings.ini
unter [serversettings] findest du die grundlegenden einstellungen
dort trägst du folgendes ein:
AllowFlyerCarryPvE=True
speicherst die datei, schliesst sie und startest erst danach ark
ist jetzt keine garantierte lösung aber einen versuch wärs wert
dieses problem hatte ich im singleplayer nie deswegen probiers einfach mal aus
noch eine frage....
wie verlässt du denn das spiel?
gehst du zurück zum startmenü oder schliesst du ark über den taskmanager?
bei zweiterem könnte das der auslöser sein da ja erst gespeichert wird wenn man während man wieder ins hauptmenü zurückkehrt
mehr idden falln mir da grad nicht zu ein 
Das gleiche Phänomen habe ich wenn ich die Tastaturbelegung ändere. Nach einem Neustart ist die Änderung auch wieder weg. Ich habe mir die Konfiguration jetzt auch komplerr in die ini geschrieben und die Datei schreibgeschützt gemacht.
Ja, ich kann jetzt halt übers Spiel keine Änderung mehr machen.
ok scheint zu funktionieren 
super danke dir für den tipp
jetzt müsst ich nur noch irgendwie den anzeige fehler wegbekommen (Reperatur/Sand-Feuersturm Anzeige nur grau ) dann könnte man ark wieder in ruhe spielen 
das wirst du nicht wegbekommen
den anzeigefehler hat soweit es mir bekannt ist jeder^^
